秘卷碎片在游戏中是解锁和强化秘卷技能的核心材料，其直接能力体现在对忍者战力的增幅上。收集足够的碎片后，玩家可以在秘卷界面进行激活或升级操作。每个秘卷通常需要五个碎片来完成初始激活，使其变为可用状态。而激活后继续投入碎片则能提升秘卷的等级，等级越高带来的属性加成就越显著，例如缩短技能冷却时间、提升伤害输出或增强控制效果等。秘卷碎片最基础的能力就是作为养成材料，将一个个功能各异的秘卷从无到有、从弱到强地打造出来，成为忍者搭配中不可或缺的一环。优先将碎片用于升级霸体、扦插之术等在实战中效果突出的常用秘卷，往往是提升战斗效率的关键。
秘卷碎片本身不具备直接战斗效果，其价值通过兑换成的秘卷技能来体现。这些技能种类繁多，功能各异，大体可分为几个方向。一是自我保护类，如通灵·手里剑护身或水遁·水乱波，能在身边形成防护或击退近身敌人，为忍者创造安全空间。二是强力攻击与消耗类，像火遁·鼠毛玉能自动追踪敌人，风遁·压害可吸附对手并造成高额伤害，主要用于弥补输出或远程消耗。三是击飞控制型，例如水遁·水冲波、木遁·扦插之术，能有效地起手或限制敌人行动，为后续连招创造机会。四是特殊功能型，如禁术·阴愈伤灭提供霸体状态，解术散可驱散对手增益，用于反制特定战术。碎片正是开启这些战术选择大门的钥匙。
获取秘卷碎片是发挥其能力的先决条件，主要途径围绕日常与限时活动展开。最稳定可靠的方式是参与小队突袭，建议每天打满次数，并且前三次挑战使用金币进行翻倍奖励，能高效积累碎片。游戏中的限时活动，例如各种组队挑战秘境，也是碎片的重要来源，通关特定次数往往能一次性获得可观的数量。对于愿意投入资源的玩家，游戏商店会周期性上架秘卷礼包，其中每周限购的疾风传秘卷礼包性价比较高，可以针对性补足碎片缺口。积极参与决斗场段位赛，通过提升段位获取赛季奖励以及完成每日任务，也有机会从宝箱中开出随机的秘卷碎片。
秘卷技能释放的时机本身就是一种高阶能力体现，而这依赖于玩家对已激活秘卷的理解。消耗输出型秘卷可以在开局时用于远程蹭血，或在自身技能处于冷却时填补输出空档。击飞控制型秘卷通常用作先手，成功命中后能衔接忍者的技能进行连招。而当被对手压制、陷入被动时，自我保护型秘卷如霸体或范围击退技能，可以立刻使用来打断对方的进攻节奏，争取喘息和反击的机会。不同定位的忍者适配不同功能的秘卷，例如缺乏自保能力的远程忍者可能更需要防护或控制类秘卷，而突进型忍者则可能利用控制秘卷来确保先手命中。
秘卷有普通秘卷与疾风传秘卷之分，它们的碎片获取途径有区别，能力侧重也不同。普通秘卷的碎片主要通过小队突袭等日常玩法产出，种类覆盖了大多数基础功能。而疾风传秘卷的碎片则主要通过限时活动、特定礼包或忍法帖活动等途径获得，它们通常拥有更独特或更具战略性的效果，例如气旋、雷电击等，常被称为黑科技，能与某些特定忍者产生非常强力的配合效果。在规划碎片收集和使用时，区分这两类秘卷的目标来源很重要。
